11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_R0012 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_R0012  tRNA-Sec  100 
 
 		 96 bp  190  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0061  tRNA-Sec  96.67 
 
 		 95 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0060  tRNA-Sec  96.67 
 
 		 95 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0057  tRNA-Sec  96.67 
 
 		 95 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04240  tRNA-Sec  96.67 
 
 		 96 bp  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.203915 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0056  tRNA-Sec  96.67 
 
 		 96 bp  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0056  tRNA-Sec  96.67 
 
 		 95 bp  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.723618  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09640  tRNA-Sec  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.726499  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0055  tRNA-Sec  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.723618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0027  tRNA-Sec  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.106298  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0028  tRNA-Sec  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0809738  normal  0.019616 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>