15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_R0028 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_R0028  tRNA-Sec  100 
 
 		 92 bp  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0809738  normal  0.019616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0027  tRNA-Sec  98.91 
 
 		 92 bp  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.106298  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0026  tRNA-Sec  88.04 
 
 		 96 bp  95.6  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00706774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09640  tRNA-Sec  88.31 
 
 		 91 bp  81.8  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.726499  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0055  tRNA-Sec  88.31 
 
 		 91 bp  81.8  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.723618  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0056  tRNA-Sec  88.31 
 
 		 95 bp  81.8  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.723618  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04240  tRNA-Sec  85.87 
 
 		 96 bp  79.8  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.203915 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0056  tRNA-Sec  85.87 
 
 		 96 bp  79.8  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0061  tRNA-Sec  100 
 
 		 95 bp  54  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0060  tRNA-Sec  100 
 
 		 95 bp  54  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0057  tRNA-Sec  100 
 
 		 95 bp  54  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-SeC(p)-1  tRNA-Sec  96.43 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0050  tRNA-Sec  96.43 
 
 		 94 bp  48.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000183308  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16920  tRNA-Sec  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325535  normal  0.582731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0012  tRNA-Sec  96.15 
 
 		 96 bp  44.1  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>