12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1603 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1603  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  634    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3661  hypothetical protein  93.62 
 
 		 329 aa  595  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1966  hypothetical protein  35.76 
 
 		 313 aa  162  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322871 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1923  hypothetical protein  38.05 
 
 		 355 aa  147  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0485  hypothetical protein  28.99 
 
 		 349 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1915  hypothetical protein  40.69 
 
 		 385 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.592529  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2238  hypothetical protein  31.33 
 
 		 367 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.380109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2285  hypothetical protein  31.33 
 
 		 367 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.941068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2277  hypothetical protein  31.33 
 
 		 367 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3127  hypothetical protein  31.87 
 
 		 369 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2147  hypothetical protein  34.76 
 
 		 363 aa  123  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.297836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4098  hypothetical protein  36.81 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>