17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0479 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0479  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  187  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.633454  normal  0.0585826 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4441  hypothetical protein  39.56 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121424  hitchhiker  0.0086839 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6566  protein of unknown function DUF909  34.41 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3211  protein of unknown function DUF909  32.26 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.803833  normal  0.157723 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3206  protein of unknown function DUF909  32.26 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.169521 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04410  hypothetical protein  27.47 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.371802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0611  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0306  hypothetical protein  29.67 
 
 		 98 aa  50.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00432617  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0691  hypothetical protein  28.72 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.740848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4956  hypothetical protein  35.56 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.256923  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1465  hypothetical protein  35.14 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.330976  normal  0.403002 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0766  early secretory antigenic target, 6 kDa  30.11 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13910  6 kDa early secretory antigenic target esxA (Esat-6)  28.24 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000328363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1020  protein of unknown function DUF909  29.03 
 
 		 98 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0147256 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1156  hypothetical protein  42.65 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.226038 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1146  hypothetical protein  42.65 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.588241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1129  hypothetical protein  42.65 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>