18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1020 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1020  protein of unknown function DUF909  100 
 
 
98 aa  196  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0147256 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1146  hypothetical protein  36.14 
 
 
98 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.588241 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1156  hypothetical protein  36.14 
 
 
98 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.226038 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1129  hypothetical protein  36.14 
 
 
98 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6566  protein of unknown function DUF909  34.12 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4441  hypothetical protein  35.96 
 
 
97 aa  53.9  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121424  hitchhiker  0.0086839 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4956  hypothetical protein  30 
 
 
98 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.256923  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3206  protein of unknown function DUF909  27.17 
 
 
94 aa  50.4  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.169521 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3211  protein of unknown function DUF909  27.17 
 
 
94 aa  50.4  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.803833  normal  0.157723 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13481  Esat-6 like protein esxT  32.53 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000364894  hitchhiker  0.00147797 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1465  hypothetical protein  30 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.330976  normal  0.403002 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0611  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0408  hypothetical protein  34.12 
 
 
93 aa  47  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04110  hypothetical protein  32.94 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04410  hypothetical protein  30.14 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.371802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0479  hypothetical protein  29.03 
 
 
95 aa  45.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.633454  normal  0.0585826 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2054  protein of unknown function DUF909  31.17 
 
 
96 aa  43.9  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0529736  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0837  hypothetical protein  35 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.712885  normal  0.155543 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>