18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0738 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0738    100 
 
 
974 bp  1931    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000736258  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2745  hypothetical protein  96.93 
 
 
447 bp  454  1e-125  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.493  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2194    82.05 
 
 
756 bp  87.7  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2655    82.05 
 
 
2330 bp  87.7  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.000297792  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2643    82.05 
 
 
1285 bp  87.7  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2632  transposase IS4 family protein  82.05 
 
 
1095 bp  87.7  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.17948  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2347  transposase IS4 family protein  82.05 
 
 
1095 bp  87.7  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0455002  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2325    82.05 
 
 
2327 bp  87.7  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0486807  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2273  transposase IS4 family protein  82.05 
 
 
1095 bp  87.7  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0283    82.05 
 
 
2747 bp  87.7  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1351  transposase IS4 family protein  82.05 
 
 
1095 bp  87.7  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0683    82.05 
 
 
2327 bp  87.7  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.000431715  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0284  transposase IS4 family protein  82.05 
 
 
1095 bp  87.7  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1447    86.59 
 
 
564 bp  75.8  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0342292  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2378    83.64 
 
 
978 bp  75.8  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2144    83.08 
 
 
1009 bp  67.9  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0533    85.37 
 
 
2426 bp  67.9  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0600    92.11 
 
 
1025 bp  52  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000130033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>