19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0600 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2820    97.47 
 
 		 1022 bp  1808    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0600    100 
 
 		 1025 bp  2032    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000130033  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2417    96.29 
 
 		 779 bp  1285    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.008461  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2419    97.99 
 
 		 249 bp  454  1e-125  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000770339  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2144    86.73 
 
 		 1009 bp  170  5e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2378    89.38 
 
 		 978 bp  170  5e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2273  transposase IS4 family protein  91.11 
 
 		 1095 bp  58  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2655    91.11 
 
 		 2330 bp  58  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.000297792  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2643    91.11 
 
 		 1285 bp  58  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2632  transposase IS4 family protein  91.11 
 
 		 1095 bp  58  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.17948  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2325    91.11 
 
 		 2327 bp  58  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0486807  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0283    91.11 
 
 		 2747 bp  58  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2194    91.11 
 
 		 756 bp  58  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1351  transposase IS4 family protein  91.11 
 
 		 1095 bp  58  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0683    91.11 
 
 		 2327 bp  58  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.000431715  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0533    91.11 
 
 		 2426 bp  58  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0284  transposase IS4 family protein  91.11 
 
 		 1095 bp  58  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0738    92.11 
 
 		 974 bp  52  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000736258  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2347  transposase IS4 family protein  90.24 
 
 		 1095 bp  50.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0455002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>