24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4387 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4387  hypothetical protein  100 
 
 		 52 aa  103  8e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129081 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000079  hypothetical protein  72.09 
 
 		 63 aa  60.5  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.231186  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05692  hypothetical protein  60 
 
 		 62 aa  58.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1408  hypothetical protein  72.5 
 
 		 67 aa  57.4  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2885  hypothetical protein  66.67 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0117  hypothetical protein  58.49 
 
 		 53 aa  51.6  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4779  hypothetical protein  85 
 
 		 49 aa  50.4  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.151068  unclonable  0.00000000788092 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1538  hypothetical protein  72.5 
 
 		 53 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.038639  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0287  hypothetical protein  89.19 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000239094  hitchhiker  0.000000000863491 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2391  hypothetical protein  52.83 
 
 		 54 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.595265  hitchhiker  0.00196894 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4421  hypothetical protein  86.49 
 
 		 60 aa  47  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0292  hypothetical protein  78.57 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000163282  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2863  hypothetical protein  60 
 
 		 59 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.327982 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0304  hypothetical protein  78.57 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000261079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1658  hypothetical protein  56.82 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.222694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3136  hypothetical protein  50 
 
 		 51 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0299  hypothetical protein  83.33 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000880989  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3732  hypothetical protein  87.88 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00346538  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0300  hypothetical protein  83.33 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00679932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0402  hypothetical protein  76.92 
 
 		 54 aa  41.6  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000918691  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0287  hypothetical protein  84.85 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000322851  decreased coverage  0.00000000141072 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3277  hypothetical protein  57.14 
 
 		 51 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.878206 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2580  hypothetical protein  50 
 
 		 51 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0777  hypothetical protein  47.92 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>