24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0299 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_0299  hypothetical protein  100 
 
 
78 aa  154  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000880989  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0292  hypothetical protein  93.06 
 
 
86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000163282  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0304  hypothetical protein  82.89 
 
 
83 aa  103  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000261079  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0300  hypothetical protein  81.82 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00679932  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000079  hypothetical protein  57.63 
 
 
63 aa  57  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.231186  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2863  hypothetical protein  65.96 
 
 
59 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.327982 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0117  hypothetical protein  57.69 
 
 
53 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0402  hypothetical protein  73.08 
 
 
54 aa  55.1  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000918691  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1408  hypothetical protein  57.41 
 
 
67 aa  54.3  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05692  hypothetical protein  72.22 
 
 
62 aa  52.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0287  hypothetical protein  78.26 
 
 
63 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000239094  hitchhiker  0.000000000863491 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2391  hypothetical protein  60.78 
 
 
54 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.595265  hitchhiker  0.00196894 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2885  hypothetical protein  63.16 
 
 
64 aa  52.4  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4421  hypothetical protein  76.09 
 
 
60 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4779  hypothetical protein  70 
 
 
49 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.151068  unclonable  0.00000000788092 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3277  hypothetical protein  65.91 
 
 
51 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.878206 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2580  hypothetical protein  59.57 
 
 
51 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3136  hypothetical protein  63.64 
 
 
51 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1538  hypothetical protein  69.44 
 
 
53 aa  45.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.038639  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3732  hypothetical protein  78.26 
 
 
63 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00346538  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0112  hypothetical protein  68.52 
 
 
60 aa  44.3  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0287  hypothetical protein  76.09 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000322851  decreased coverage  0.00000000141072 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4387  hypothetical protein  83.33 
 
 
52 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129081 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0095  hypothetical protein  65.45 
 
 
68 aa  41.6  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>