15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3831 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3831  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  304  3e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000359766 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0729  hypothetical protein  89.58 
 
 		 126 aa  97.4  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3475  hypothetical protein  51.67 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002903  hypothetical protein  43.81 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03055  hypothetical protein  42.97 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1591  hypothetical protein  70.73 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3704  hypothetical protein  46.77 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6585  hypothetical protein  52.27 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000000266861  normal  0.0338077 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0662  hypothetical protein  43.24 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.520931  normal  0.106554 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0663  hypothetical protein  49.12 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.279583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3359  hypothetical protein  49.12 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0226874 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3678  hypothetical protein  40.48 
 
 		 105 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985975  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0675  hypothetical protein  44.62 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0706  hypothetical protein  36.9 
 
 		 98 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0696  hypothetical protein  35.71 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>