13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3359 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0663  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  225  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.279583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3359  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  225  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0226874 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0662  hypothetical protein  67.26 
 
 		 115 aa  146  7e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.520931  normal  0.106554 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0675  hypothetical protein  53.85 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0696  hypothetical protein  51.35 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0706  hypothetical protein  50 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3678  hypothetical protein  50.72 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985975  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3831  hypothetical protein  49.12 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000359766 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0729  hypothetical protein  41.03 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3704  hypothetical protein  38.33 
 
 		 184 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03055  hypothetical protein  40.86 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3475  hypothetical protein  40.68 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002903  hypothetical protein  41.82 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>