16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3520 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3520  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  298  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2988  hypothetical protein  84.14 
 
 		 145 aa  232  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0442194  normal  0.198385 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3190  hypothetical protein  70.34 
 
 		 162 aa  228  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.197114  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2976  hypothetical protein  71.03 
 
 		 145 aa  218  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0273469  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3856  hypothetical protein  64.08 
 
 		 144 aa  201  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3189  hypothetical protein  61.97 
 
 		 144 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.843747  hitchhiker  0.000188567 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0775  hypothetical protein  62.68 
 
 		 144 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166535  normal  0.0251261 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0749  hypothetical protein  62.68 
 
 		 144 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0457515 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0675  hypothetical protein  59.86 
 
 		 144 aa  186  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3635  hypothetical protein  59.86 
 
 		 144 aa  186  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0155201  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3758  hypothetical protein  59.86 
 
 		 144 aa  186  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.307291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3567  hypothetical protein  59.86 
 
 		 144 aa  186  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0783  hypothetical protein  60.56 
 
 		 144 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0252082  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0832  hypothetical protein  52.78 
 
 		 144 aa  169  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2622  hypothetical protein  52.82 
 
 		 144 aa  166  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0735  hypothetical protein  51.41 
 
 		 144 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>