17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0735 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_0735  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  297  4e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0832  hypothetical protein  81.12 
 
 
144 aa  245  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0775  hypothetical protein  68.75 
 
 
144 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166535  normal  0.0251261 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0749  hypothetical protein  68.75 
 
 
144 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0457515 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3856  hypothetical protein  67.36 
 
 
144 aa  211  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3189  hypothetical protein  67.83 
 
 
144 aa  207  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.843747  hitchhiker  0.000188567 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0783  hypothetical protein  63.89 
 
 
144 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0252082  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3567  hypothetical protein  63.89 
 
 
144 aa  195  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3758  hypothetical protein  63.89 
 
 
144 aa  195  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.307291  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3635  hypothetical protein  63.89 
 
 
144 aa  195  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0155201  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0675  hypothetical protein  63.89 
 
 
144 aa  195  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3190  hypothetical protein  58.74 
 
 
162 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.197114  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3520  hypothetical protein  51.41 
 
 
145 aa  168  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2976  hypothetical protein  55.24 
 
 
145 aa  168  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0273469  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2622  hypothetical protein  48.25 
 
 
144 aa  153  9e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2988  hypothetical protein  49.3 
 
 
145 aa  140  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0442194  normal  0.198385 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0596  hypothetical protein  28.12 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  4.33635e-18  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>