14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0136 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0136  hypothetical protein  100 
 
 		 72 aa  153  8e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0099  hypothetical protein  61.76 
 
 		 74 aa  94  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3671  hypothetical protein  43.08 
 
 		 68 aa  59.7  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1470  hypothetical protein  36.62 
 
 		 71 aa  57.4  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3862  hypothetical protein  50.77 
 
 		 79 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3955  hypothetical protein  50.77 
 
 		 79 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3361  hypothetical protein  40.74 
 
 		 67 aa  50.4  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4250  hypothetical protein  44.62 
 
 		 79 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0095  hypothetical protein  43.08 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4445  hypothetical protein  43.08 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0605  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  40.35 
 
 		 70 aa  45.1  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1707  hypothetical protein  34.38 
 
 		 74 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4305  hypothetical protein  41.54 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2623  hypothetical protein  37.74 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.121297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>