14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3862 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3862  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  166  8e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3955  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  166  8e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4305  hypothetical protein  64.86 
 
 		 79 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4250  hypothetical protein  69.23 
 
 		 79 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0095  hypothetical protein  67.69 
 
 		 79 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4445  hypothetical protein  67.69 
 
 		 79 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0136  hypothetical protein  50.77 
 
 		 72 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1470  hypothetical protein  56.36 
 
 		 71 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0099  hypothetical protein  38.89 
 
 		 74 aa  63.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3671  hypothetical protein  43.94 
 
 		 68 aa  59.7  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1707  hypothetical protein  45.45 
 
 		 74 aa  57  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3361  hypothetical protein  49.06 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2623  hypothetical protein  49.06 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.121297  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0605  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  49.09 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>