17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1321 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1321  hypothetical protein  100 
 
 
64 aa  125  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2672  hypothetical protein  81.25 
 
 
64 aa  107  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2740  hypothetical protein  81.25 
 
 
64 aa  107  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2847  hypothetical protein  81.25 
 
 
64 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2934  hypothetical protein  90.62 
 
 
64 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.380988  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1446  hypothetical protein  90.62 
 
 
64 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1412  hypothetical protein  90.62 
 
 
64 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1420  hypothetical protein  90.62 
 
 
64 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3711  hypothetical protein  70.31 
 
 
64 aa  86.7  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3999  hypothetical protein  62.5 
 
 
64 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4136  hypothetical protein  54.69 
 
 
64 aa  69.3  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.208724  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01266  hypothetical protein  53.12 
 
 
64 aa  60.1  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.204518  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1490  hypothetical protein  42.68 
 
 
90 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.169523  hitchhiker  0.000314607 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001939  hypothetical protein  41.54 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0265  hypothetical protein  50 
 
 
55 aa  46.2  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0107016 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0446  hypothetical protein  51.85 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00904769  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1578  hypothetical protein  36.36 
 
 
63 aa  40  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>