16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4136 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4136  hypothetical protein  100 
 
 		 64 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.208724  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3999  hypothetical protein  62.5 
 
 		 64 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2847  hypothetical protein  56.25 
 
 		 64 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2672  hypothetical protein  54.69 
 
 		 64 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2740  hypothetical protein  54.69 
 
 		 64 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3711  hypothetical protein  54.69 
 
 		 64 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1420  hypothetical protein  57.81 
 
 		 64 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1412  hypothetical protein  57.81 
 
 		 64 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1446  hypothetical protein  57.81 
 
 		 64 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2934  hypothetical protein  57.81 
 
 		 64 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.380988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01266  hypothetical protein  71.43 
 
 		 64 aa  62.8  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.204518  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1321  hypothetical protein  53.12 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001939  hypothetical protein  41.54 
 
 		 65 aa  51.2  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0265  hypothetical protein  56.25 
 
 		 55 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0107016 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1490  hypothetical protein  62.86 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.169523  hitchhiker  0.000314607 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3048  hypothetical protein  38.6 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>