15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1198 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1198  replication initiator A domain protein  100 
 
 		 117 aa  230  6e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0907  replication initiator A domain protein  55.36 
 
 		 116 aa  128  3e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C57  hypothetical protein  47.17 
 
 		 330 aa  99  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2756  replication initiator A domain-containing protein  48.45 
 
 		 327 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2800  replication initiator A domain-containing protein  48.45 
 
 		 327 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0646  replication initiator A domain protein  43 
 
 		 251 aa  84  7e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0033  replication-associated protein RepA  44.44 
 
 		 344 aa  82  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.34337  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1053  hypothetical protein  39.25 
 
 		 323 aa  78.6  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1801  replication initiator A domain protein  37 
 
 		 257 aa  74.3  0.0000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1267  hypothetical protein  37.86 
 
 		 313 aa  72.4  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.831381  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0222  hypothetical protein  33.71 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.630289  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1299  hypothetical protein  31.71 
 
 		 272 aa  50.8  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.845629  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3912  replication initiator A domain protein  30.56 
 
 		 306 aa  48.9  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0899644  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5710  replication initiator A domain-containing protein  33.33 
 
 		 375 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.799252  normal  0.697856 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3622  replication protein, putative  33.33 
 
 		 375 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>