15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0646 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0646  replication initiator A domain protein  100 
 
 
251 aa  508  1e-143  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1801  replication initiator A domain protein  41.7 
 
 
257 aa  196  3e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0907  replication initiator A domain protein  45 
 
 
116 aa  89.7  4e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1198  replication initiator A domain protein  43 
 
 
117 aa  84  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1267  hypothetical protein  29.59 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.831381  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0033  replication-associated protein RepA  33.64 
 
 
344 aa  68.9  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.34337  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2756  replication initiator A domain-containing protein  30.09 
 
 
327 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2800  replication initiator A domain-containing protein  30.09 
 
 
327 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1053  hypothetical protein  32.71 
 
 
323 aa  60.1  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C57  hypothetical protein  29.59 
 
 
330 aa  55.5  0.0000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1793  phage replisome organizer  38.33 
 
 
244 aa  51.6  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.128915  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3912  replication initiator A domain protein  29.73 
 
 
306 aa  48.9  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0899644  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1299  hypothetical protein  28.89 
 
 
272 aa  45.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.845629  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0222  hypothetical protein  28.24 
 
 
108 aa  43.9  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.630289  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0862  hypothetical protein  52.5 
 
 
42 aa  42.7  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>