59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5705 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5705  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  275  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0904367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3229  hypothetical protein  34.33 
 
 		 240 aa  89.7  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0929  hypothetical protein  34.59 
 
 		 117 aa  89.4  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00515695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0491  hypothetical protein  33.08 
 
 		 117 aa  89  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3154  protein of unknown function DUF1428  33.08 
 
 		 117 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.422128  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00411  hypothetical protein  33.08 
 
 		 117 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00407  hypothetical protein  33.08 
 
 		 117 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0546  hypothetical protein  33.08 
 
 		 117 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.275421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0385  hypothetical protein  33.08 
 
 		 117 aa  88.2  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3160  hypothetical protein  33.08 
 
 		 117 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0499  hypothetical protein  33.08 
 
 		 117 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2220  hypothetical protein  36.09 
 
 		 117 aa  86.3  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.885016  normal  0.454909 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0015  hypothetical protein  32.58 
 
 		 240 aa  86.3  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229573  normal  0.0524165 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003305  RNA signal recognition particle 4.5S RNA  34.59 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2175  hypothetical protein  33.33 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.419473  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2941  protein of unknown function DUF1428  34.85 
 
 		 117 aa  84  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.330659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2114  hypothetical protein  34.59 
 
 		 117 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296895  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2681  protein of unknown function DUF1428  34.09 
 
 		 117 aa  83.6  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2817  hypothetical protein  32.33 
 
 		 117 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2739  hypothetical protein  32.33 
 
 		 117 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2517  hypothetical protein  33.08 
 
 		 117 aa  81.6  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.665087 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3625  hypothetical protein  33.58 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2085  hypothetical protein  33.58 
 
 		 117 aa  81.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0532  hypothetical protein  32.54 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2283  hypothetical protein  32.84 
 
 		 118 aa  80.5  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4781  protein of unknown function DUF1428  32.84 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3690  hypothetical protein  31.82 
 
 		 115 aa  79.7  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4414  protein of unknown function DUF1428  28.24 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147422  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0270  protein of unknown function DUF1428  30.83 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0204818  normal  0.61252 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2456  hypothetical protein  30.08 
 
 		 248 aa  77  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318638 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2597  protein of unknown function DUF1428  33.08 
 
 		 117 aa  76.6  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0842324 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3602  hypothetical protein  29.85 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.478071 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4031  hypothetical protein  32.33 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.035268  normal  0.279701 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2159  hypothetical protein  32.09 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1072  hypothetical protein  32.84 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5116  protein of unknown function DUF1428  30.08 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2327  hypothetical protein  30.37 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.427422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1916  hypothetical protein  32.82 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1525  protein of unknown function DUF1428  28.68 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000627742 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3173  hypothetical protein  28.36 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1972  hypothetical protein  32.82 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3069  response regulator receiver domain-containing protein  32.81 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0231164 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0413  protein of unknown function DUF1428  27.82 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.260768  normal  0.145448 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0827  protein of unknown function DUF1428  30.83 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.201649  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2057  hypothetical protein  26.12 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.533414  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0825  hypothetical protein  28.79 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0934  hypothetical protein  28.79 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1610  protein of unknown function DUF1428  28.35 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2264  hypothetical protein  28.35 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.254967  normal  0.810632 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1964  hypothetical protein  28.68 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01990  Protein of unknown function (DUF1428)  32.26 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3631  hypothetical protein  27.07 
 
 		 237 aa  63.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.222359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0137  hypothetical protein  27.61 
 
 		 115 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.413698 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1487  hypothetical protein  27.61 
 
 		 115 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.321104  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4952  protein of unknown function DUF1428  26.52 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1438  hypothetical protein  28.36 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.835257  normal  0.874863 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1314  hypothetical protein  28.46 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1494  protein of unknown function DUF1428  28.46 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3674  protein of unknown function DUF1428  26.15 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>