28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4374 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4374  hypothetical protein  100 
 
 		 62 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2606  hypothetical protein  81.67 
 
 		 61 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2391  hypothetical protein  78.69 
 
 		 61 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.309871  hitchhiker  0.00338886 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0947  hypothetical protein  80 
 
 		 61 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.829702  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2148  hypothetical protein  78.69 
 
 		 61 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145621 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2967  hypothetical protein  78.33 
 
 		 61 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.95143  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3503  hypothetical protein  80.33 
 
 		 62 aa  70.5  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.398301 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1698  hypothetical protein  79.31 
 
 		 62 aa  65.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.238008  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2399  hypothetical protein  75.81 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.488698  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5067  hypothetical protein  75.81 
 
 		 62 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.79562  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0820  hypothetical protein  76.67 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0826  hypothetical protein  76.67 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0806  hypothetical protein  72.13 
 
 		 62 aa  60.5  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.315008  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4294  hypothetical protein  73.77 
 
 		 62 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1352  hypothetical protein  68.85 
 
 		 63 aa  57  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2586  hypothetical protein  80 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.980459 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1526  hypothetical protein  76 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6478  hypothetical protein  65.52 
 
 		 62 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1351  hypothetical protein  65.52 
 
 		 62 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.34381  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3118  hypothetical protein  65.57 
 
 		 62 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.862995  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2994  hypothetical protein  65.57 
 
 		 62 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.797999  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1344  hypothetical protein  65.57 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6068  hypothetical protein  65.52 
 
 		 62 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242367  normal  0.0702761 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6345  hypothetical protein  65.52 
 
 		 60 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275627  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5615  hypothetical protein  65.52 
 
 		 60 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.918305  normal  0.164206 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7020  hypothetical protein  63.79 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0418  hypothetical protein  82 
 
 		 61 aa  51.6  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1638  hypothetical protein  68.97 
 
 		 60 aa  50.8  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.367487  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>