28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1351 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_1351  hypothetical protein  100 
 
 
62 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.34381  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6478  hypothetical protein  100 
 
 
62 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742546  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6068  hypothetical protein  98.39 
 
 
62 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242367  normal  0.0702761 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6345  hypothetical protein  95 
 
 
60 aa  87  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275627  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5615  hypothetical protein  95 
 
 
60 aa  87  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.918305  normal  0.164206 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7020  hypothetical protein  87.1 
 
 
62 aa  84.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221839  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2994  hypothetical protein  81.36 
 
 
62 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.797999  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3118  hypothetical protein  81.36 
 
 
62 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.862995  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1344  hypothetical protein  81.36 
 
 
85 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2967  hypothetical protein  72.88 
 
 
61 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.95143  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5067  hypothetical protein  77.05 
 
 
62 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.79562  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0947  hypothetical protein  71.19 
 
 
61 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.829702  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2606  hypothetical protein  71.19 
 
 
61 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2148  hypothetical protein  68.97 
 
 
61 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145621 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2391  hypothetical protein  67.24 
 
 
61 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.309871  hitchhiker  0.00338886 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1638  hypothetical protein  67.8 
 
 
60 aa  55.1  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.367487  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1698  hypothetical protein  69.49 
 
 
62 aa  53.5  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.238008  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2586  hypothetical protein  69.64 
 
 
64 aa  52.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.980459 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1352  hypothetical protein  67.24 
 
 
63 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4294  hypothetical protein  67.8 
 
 
62 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0806  hypothetical protein  67.24 
 
 
62 aa  51.2  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.315008  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4374  hypothetical protein  65.52 
 
 
62 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1526  hypothetical protein  72 
 
 
89 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0826  hypothetical protein  60.66 
 
 
65 aa  47.4  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0820  hypothetical protein  60.66 
 
 
65 aa  47.4  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3503  hypothetical protein  60.34 
 
 
62 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.398301 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2399  hypothetical protein  59.02 
 
 
65 aa  44.7  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.488698  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0418  hypothetical protein  74 
 
 
61 aa  44.3  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>