32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3106 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3106  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  314  3e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2732  hypothetical protein  53.9 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0813515 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0487  GCN5-related N-acetyltransferase  48.41 
 
 		 159 aa  154  4e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1042  GCN5-related N-acetyltransferase  46.2 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000821208  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1176  GCN5-related N-acetyltransferase  50.66 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0249  hypothetical protein  51.61 
 
 		 158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0852078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6682  GCN5-related N-acetyltransferase  47.4 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.389522 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5778  GCN5-related N-acetyltransferase  46.75 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0636391  normal  0.0324458 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2740  GCN5-related N-acetyltransferase  49.34 
 
 		 151 aa  123  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1127  hypothetical protein  43.59 
 
 		 165 aa  122  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.110194  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1698  acetyltransferase  38.66 
 
 		 287 aa  89.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1895  acetyltransferase, GNAT family  38.66 
 
 		 283 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1673  acetyltransferase  37.3 
 
 		 287 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1942  acetyltransferase  36.51 
 
 		 283 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1721  acetyltransferase  37.82 
 
 		 287 aa  85.5  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1857  acetyltransferase  37.82 
 
 		 287 aa  85.5  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3484  acetyltransferase, GNAT family  37.61 
 
 		 283 aa  84.7  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1973  acetyltransferase, GNAT family  37.61 
 
 		 283 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4514  GCN5-related N-acetyltransferase  37.86 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1858  acetyltransferase, GNAT family  37.61 
 
 		 286 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1715  acetyltransferase  33.59 
 
 		 287 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.33204  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0405  GCN5-related N-acetyltransferase  35.09 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5696  hypothetical protein  41.74 
 
 		 289 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0270  GCN5-related N-acetyltransferase  39.13 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396885 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0313  GCN5-related N-acetyltransferase  37.39 
 
 		 309 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2818  hypothetical protein  33.58 
 
 		 318 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1661  GCN5-related N-acetyltransferase  40.87 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.589958  normal  0.183786 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6776  GCN5-related N-acetyltransferase  35.88 
 
 		 318 aa  54.3  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.698643 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2571  GCN5-related N-acetyltransferase  30.84 
 
 		 316 aa  46.6  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3422  GCN5-related N-acetyltransferase  40.62 
 
 		 166 aa  44.3  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.411677  normal  0.803499 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20190  acetyltransferase (GNAT) family protein  36.11 
 
 		 329 aa  43.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2269  GCN5-related N-acetyltransferase  40.62 
 
 		 168 aa  41.6  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.95966 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>