29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2732 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_2732  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  339  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0813515 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3106  hypothetical protein  53.9 
 
 
161 aa  155  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1176  GCN5-related N-acetyltransferase  49.68 
 
 
153 aa  152  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1042  GCN5-related N-acetyltransferase  45 
 
 
162 aa  150  5.9999999999999996e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000821208  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0249  hypothetical protein  45.86 
 
 
158 aa  147  6e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0852078  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0487  GCN5-related N-acetyltransferase  45.28 
 
 
159 aa  144  6e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5778  GCN5-related N-acetyltransferase  46.1 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0636391  normal  0.0324458 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6682  GCN5-related N-acetyltransferase  44.52 
 
 
159 aa  137  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.389522 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1127  hypothetical protein  36.05 
 
 
165 aa  114  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.110194  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2740  GCN5-related N-acetyltransferase  45.33 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1973  acetyltransferase, GNAT family  35.25 
 
 
283 aa  84.7  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1698  acetyltransferase  35.54 
 
 
287 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1895  acetyltransferase, GNAT family  35.54 
 
 
283 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3484  acetyltransferase, GNAT family  35.25 
 
 
283 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1673  acetyltransferase  33.88 
 
 
287 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1858  acetyltransferase, GNAT family  32.41 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1715  acetyltransferase  33.33 
 
 
287 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.33204  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1942  acetyltransferase  34.71 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1721  acetyltransferase  33.06 
 
 
287 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1857  acetyltransferase  33.06 
 
 
287 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4514  GCN5-related N-acetyltransferase  37.14 
 
 
297 aa  77.4  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435481  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0270  GCN5-related N-acetyltransferase  39.68 
 
 
309 aa  75.5  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396885 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0313  GCN5-related N-acetyltransferase  38.89 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0405  GCN5-related N-acetyltransferase  29.71 
 
 
300 aa  63.9  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5696  hypothetical protein  36.67 
 
 
289 aa  62  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579779  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1661  GCN5-related N-acetyltransferase  38.06 
 
 
287 aa  58.5  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.589958  normal  0.183786 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2818  hypothetical protein  28.74 
 
 
318 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2571  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 
316 aa  41.6  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6776  GCN5-related N-acetyltransferase  33.59 
 
 
318 aa  41.2  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.698643 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>