30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1989 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1989  TfuA domain-containing protein  100 
 
 		 258 aa  508  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6311  TfuA domain protein core  44.13 
 
 		 464 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2070  TfuA-like protein  38.91 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3471  TfuA domain-containing protein  43.4 
 
 		 451 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1210  TfuA domain protein core  38.5 
 
 		 208 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0526  TfuA-like, core  37.14 
 
 		 213 aa  125  6e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1332  TfuA domain-containing protein  44.6 
 
 		 217 aa  124  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6038  TfuA domain protein core  41.47 
 
 		 247 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.345548  normal  0.623723 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2262  TfuA-like  38.36 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.154499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6107  TfuA domain-containing protein  37.27 
 
 		 456 aa  116  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.620154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7196  TfuA domain protein core  41.15 
 
 		 247 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.503615  normal  0.0994766 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4529  TfuA domain-containing protein  39.35 
 
 		 234 aa  115  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.357658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2956  TfuA domain protein core  41.71 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1977  TfuA domain-containing protein  36.79 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0265574  normal  0.793064 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11405  hypothetical protein  36.99 
 
 		 497 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000176066  normal  0.617932 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0590  hypothetical protein  35.32 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0804976  hitchhiker  0.00134813 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1402  TfuA domain-containing protein  41.46 
 
 		 208 aa  105  5e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0918  TfuA domain-containing protein  41.11 
 
 		 411 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.124979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3204  TfuA domain protein core  38.39 
 
 		 235 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.909027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0861  TfuA-like protein  39.11 
 
 		 403 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.060609  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0014  hypothetical protein  35.96 
 
 		 344 aa  90.1  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.175575  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0822  hypothetical protein  33.95 
 
 		 219 aa  90.1  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0010  hypothetical protein  33.79 
 
 		 344 aa  89.7  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0355  TfuA domain-containing protein  30.23 
 
 		 214 aa  88.2  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00180468 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0906  TfuA domain protein core  38.71 
 
 		 402 aa  85.1  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.976855  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1564  TfuA domain-containing protein  29.77 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0910  TfuA domain protein core  38.55 
 
 		 403 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000252164  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0481  TfuA domain-containing protein  29.3 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0428  TfuA domain-containing protein  30.32 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1703  hypothetical protein  29.29 
 
 		 882 aa  42.7  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>