17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1578 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1578  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  342  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0162678  decreased coverage  0.00996174 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2445  hypothetical protein  60.87 
 
 
166 aa  198  3e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.647593  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2123  hypothetical protein  59.63 
 
 
166 aa  194  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.261003  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0058  hypothetical protein  59.12 
 
 
166 aa  192  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.132822  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0282  hypothetical protein  57.14 
 
 
163 aa  188  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.876089  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0970  hypothetical protein  58.49 
 
 
158 aa  181  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.621965  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2385  hypothetical protein  54.09 
 
 
163 aa  174  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0973  hypothetical protein  54.3 
 
 
159 aa  152  1e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.17338 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2871  hypothetical protein  41.51 
 
 
151 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2983  hypothetical protein  41.51 
 
 
151 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.581927  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2765  putative cytoplasmic protein  41.51 
 
 
151 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.651747  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2849  putative cytoplasmic protein  41.51 
 
 
151 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.740518  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2867  putative cytoplasmic protein  41.51 
 
 
151 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.517071  normal  0.474137 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0816  hypothetical protein  46.53 
 
 
156 aa  124  8.000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.119206  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0920  hypothetical protein  43.59 
 
 
165 aa  117  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.270217  normal  0.0758496 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0396  hypothetical protein  37.66 
 
 
149 aa  96.7  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2109  hypothetical protein  35.81 
 
 
156 aa  89  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>