17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2867 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2983  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  311  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.581927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2867  putative cytoplasmic protein  100 
 
 		 151 aa  311  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.517071  normal  0.474137 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2871  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  311  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2849  putative cytoplasmic protein  100 
 
 		 151 aa  311  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.740518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2765  putative cytoplasmic protein  99.34 
 
 		 151 aa  310  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.651747  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2385  hypothetical protein  56.41 
 
 		 163 aa  175  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2445  hypothetical protein  52.47 
 
 		 166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.647593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0058  hypothetical protein  52.83 
 
 		 166 aa  170  7.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.132822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0282  hypothetical protein  51.25 
 
 		 163 aa  169  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.876089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2123  hypothetical protein  53.09 
 
 		 166 aa  168  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.261003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0970  hypothetical protein  52.67 
 
 		 158 aa  165  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.621965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0396  hypothetical protein  55.47 
 
 		 149 aa  153  7e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2109  hypothetical protein  55.47 
 
 		 156 aa  142  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0816  hypothetical protein  57.48 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.119206  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0973  hypothetical protein  49.3 
 
 		 159 aa  137  3.9999999999999997e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.17338 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0920  hypothetical protein  53.57 
 
 		 165 aa  136  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.270217  normal  0.0758496 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1578  hypothetical protein  41.51 
 
 		 166 aa  134  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0162678  decreased coverage  0.00996174 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>