26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1483 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1483  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  481  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4569  hypothetical protein  42.49 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0247  hypothetical protein  33.47 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.92599 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1493  hypothetical protein  33.47 
 
 		 262 aa  105  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2011  hypothetical protein  33.6 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2069  hypothetical protein  32.02 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2627  hypothetical protein  31.3 
 
 		 269 aa  99  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.433366 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0297  hypothetical protein  28.23 
 
 		 284 aa  99  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.246483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3192  hypothetical protein  32.24 
 
 		 254 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157621  normal  0.129544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2527  hypothetical protein  31.84 
 
 		 293 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.35785  normal  0.669591 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2427  hypothetical protein  34.67 
 
 		 265 aa  96.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2861  hypothetical protein  30.28 
 
 		 258 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.613567  normal  0.192183 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0123  hypothetical protein  33.63 
 
 		 280 aa  88.6  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1536  hypothetical protein  33.63 
 
 		 273 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3920  hypothetical protein  33.63 
 
 		 264 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.263137  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3304  hypothetical protein  33.63 
 
 		 264 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3066  hypothetical protein  33.63 
 
 		 273 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3001  hypothetical protein  33.63 
 
 		 273 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3992  hypothetical protein  32.74 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0115  hypothetical protein  31.8 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.973044 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0967  hypothetical protein  28.74 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1830  hypothetical protein  29.41 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0282  hypothetical protein  31.05 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140821  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7643  hypothetical protein  26.42 
 
 		 266 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3259  hypothetical protein  36.56 
 
 		 250 aa  49.3  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5347  hypothetical protein  27.31 
 
 		 269 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.7075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>