14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0152 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0152  putative integral membrane protein; putative sugar permease  100 
 
 		 335 aa  663    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.212721  hitchhiker  0.000035043 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0379  putative integral membrane protein; putative sugar permease  51.2 
 
 		 330 aa  330  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.791087 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1311  putative integral membrane protein; putative sugar permease  42.56 
 
 		 332 aa  270  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2647  putative integral membrane protein; putative sugar permease  42.39 
 
 		 331 aa  246  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161287  normal  0.22595 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4853  glucose uptake protein  26.78 
 
 		 285 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4859  glucose uptake protein  26.78 
 
 		 285 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0407  glucose uptake protein  26.36 
 
 		 285 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4835  glucose uptake protein  26.78 
 
 		 285 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4613  glucose uptake protein  26.78 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4969  glucose uptake protein  26.78 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.215917  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4829  glucose uptake protein  26.36 
 
 		 285 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4548  DMT superfamily L-rhamnose-proton symporter  25.12 
 
 		 285 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4467  glucose uptake protein  25.82 
 
 		 285 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4449  glucose uptake protein  23.71 
 
 		 285 aa  43.1  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>