14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_35280 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_35280  Htaa protein  100 
 
 		 1212 aa  2331    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0369  Htaa domain protein  31.11 
 
 		 630 aa  159  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0418  hypothetical protein  45.93 
 
 		 367 aa  120  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5626  Htaa domain protein  44.94 
 
 		 800 aa  119  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.259672 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2764  hypothetical protein  43.78 
 
 		 543 aa  114  9e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.671405  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2988  Htaa domain protein  39.39 
 
 		 994 aa  94.7  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360944  normal  0.268871 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2380  hypothetical protein  33.64 
 
 		 373 aa  90.9  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147185  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0581  Htaa domain protein  33.13 
 
 		 1098 aa  75.9  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.892764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2366  Htaa domain protein  34.88 
 
 		 1127 aa  71.6  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527032  normal  0.0458127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2877  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.67 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.651408  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2670  hypothetical protein  26.11 
 
 		 166 aa  55.5  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0145  TolA domain-containing protein  54.29 
 
 		 497 aa  48.5  0.0008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3450  hypothetical protein  27.71 
 
 		 427 aa  45.8  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0709961 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  55.56 
 
 		 1594 aa  45.4  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>