22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1960 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1960  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  141  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000224011  normal  0.835994 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2016  hypothetical protein  95.08 
 
 		 61 aa  124  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000206782  normal  0.0192826 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3496  hypothetical protein  75 
 
 		 64 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2638  hypothetical protein  85.42 
 
 		 78 aa  89.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000584551  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0097  hypothetical protein  78.85 
 
 		 54 aa  90.1  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0409  hypothetical protein  85.71 
 
 		 64 aa  89  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.76247  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3426  hypothetical protein  90.91 
 
 		 56 aa  87  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000655315  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3714  hypothetical protein  86.05 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000655627  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1485  hypothetical protein  86.36 
 
 		 80 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1756  hypothetical protein  84.09 
 
 		 52 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1124  hypothetical protein  84.09 
 
 		 47 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.332682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1116  hypothetical protein  81.82 
 
 		 49 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1105  hypothetical protein  85.71 
 
 		 58 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0538574  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2789  hypothetical protein  85.71 
 
 		 54 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000850666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4140  hypothetical protein  79.07 
 
 		 53 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3287  hypothetical protein  77.78 
 
 		 50 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000580981  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4273  hypothetical protein  76.74 
 
 		 53 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.131745 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2118  hypothetical protein  78.57 
 
 		 47 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.356514  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0791  hypothetical protein  77.27 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000670126  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4236  hypothetical protein  87.88 
 
 		 40 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000490233 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0309  hypothetical protein  76.47 
 
 		 53 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0763  hypothetical protein  100 
 
 		 73 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>