21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0763 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0763  hypothetical protein  100 
 
 		 73 aa  149  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2118  hypothetical protein  96.15 
 
 		 47 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.356514  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1756  hypothetical protein  83.33 
 
 		 52 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1485  hypothetical protein  88.89 
 
 		 80 aa  54.7  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1960  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000224011  normal  0.835994 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2016  hypothetical protein  100 
 
 		 61 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000206782  normal  0.0192826 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0097  hypothetical protein  92 
 
 		 54 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3496  hypothetical protein  92 
 
 		 64 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1105  hypothetical protein  88.46 
 
 		 58 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0538574  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2789  hypothetical protein  66.67 
 
 		 54 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000850666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2638  hypothetical protein  95.65 
 
 		 78 aa  51.2  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000584551  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1116  hypothetical protein  88.46 
 
 		 49 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3426  hypothetical protein  95.65 
 
 		 56 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000655315  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1124  hypothetical protein  95.65 
 
 		 47 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.332682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0309  hypothetical protein  63.89 
 
 		 53 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3287  hypothetical protein  75.86 
 
 		 50 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000580981  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3714  hypothetical protein  70.59 
 
 		 204 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000655627  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0409  hypothetical protein  91.3 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.76247  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4140  hypothetical protein  82.61 
 
 		 53 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0791  hypothetical protein  64.71 
 
 		 195 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000670126  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4273  hypothetical protein  78.26 
 
 		 53 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.131745 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>