12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3222 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3130  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  298  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00613353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3222  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  298  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00512264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0892  hypothetical protein  99.31 
 
 		 144 aa  295  1e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2251  hypothetical protein  56.78 
 
 		 147 aa  141  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0014  hypothetical protein  58.56 
 
 		 163 aa  131  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152579 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2085  hypothetical protein  46.72 
 
 		 145 aa  119  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0895  hypothetical protein  50 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3461  hypothetical protein  52.13 
 
 		 143 aa  98.2  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.842737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1270  hypothetical protein  44.25 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4452  hypothetical protein  51.52 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00868877 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1730  hypothetical protein  40.16 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.514096  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1927  hypothetical protein  49.38 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>