16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1554 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1554  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  233  6e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.83721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2711  hypothetical protein  71.15 
 
 		 114 aa  163  8e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.026388 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1876  hypothetical protein  71.29 
 
 		 114 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000114126 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2239  hypothetical protein  62.86 
 
 		 114 aa  148  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2477  hypothetical protein  61.9 
 
 		 114 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.437697  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2597  hypothetical protein  61.9 
 
 		 114 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.020036 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1867  hypothetical protein  61.9 
 
 		 114 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.015808  hitchhiker  0.000000593706 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2484  hypothetical protein  60.95 
 
 		 114 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2269  hypothetical protein  54.05 
 
 		 114 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0671436  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2544  hypothetical protein  58.1 
 
 		 114 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1741  hypothetical protein  64.44 
 
 		 115 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1597  hypothetical protein  65.91 
 
 		 115 aa  130  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1672  hypothetical protein  65.91 
 
 		 115 aa  130  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00631315 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2068  hypothetical protein  61.46 
 
 		 115 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.784922  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2639  hypothetical protein  55.67 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1822  hypothetical protein  46.02 
 
 		 113 aa  111  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>