23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1327 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1327  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  148  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3111  hypothetical protein  79.22 
 
 		 77 aa  123  6e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0419  putative acyl carrier protein  40.28 
 
 		 73 aa  50.8  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1493  acyl carrier protein, putative  38.89 
 
 		 73 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1306  acyl carrier protein, putative  38.89 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0335565  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5695  hypothetical protein  33.8 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.114455 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2804  hypothetical protein  37.88 
 
 		 77 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1320  acyl carrier protein, putative  37.5 
 
 		 73 aa  46.2  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.351284  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3032  hypothetical protein  36.36 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.618988 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3838  putative acyl carrier protein  33.33 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0097  putative acyl carrier protein  33.33 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.713215 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00991  acyl carrier protein  46.94 
 
 		 74 aa  44.7  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06175  acyl carrier protein  46.94 
 
 		 74 aa  44.7  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.241601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3876  putative acyl carrier protein  37.88 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3958  putative acyl carrier protein  37.88 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00426693  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3096  hypothetical protein  37.88 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125288  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1665  hypothetical protein  37.88 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3454  hypothetical protein  37.88 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0137941  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0097  hypothetical protein  37.88 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.108948  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2879  hypothetical protein  37.88 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1913  hypothetical protein  31.88 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.640818  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0275  hypothetical protein  35.9 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0227705  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2152  phosphopantetheine-binding protein  36 
 
 		 82 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>