19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2804 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2804  hypothetical protein  100 
 
 
77 aa  152  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3032  hypothetical protein  97.4 
 
 
77 aa  148  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.618988 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0097  hypothetical protein  50 
 
 
74 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.108948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3096  hypothetical protein  50 
 
 
73 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125288  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3958  putative acyl carrier protein  50 
 
 
73 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00426693  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3876  putative acyl carrier protein  50 
 
 
73 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1665  hypothetical protein  50 
 
 
73 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3454  hypothetical protein  50 
 
 
73 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0137941  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2879  hypothetical protein  50 
 
 
74 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0097  putative acyl carrier protein  47.83 
 
 
88 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.713215 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3838  putative acyl carrier protein  44.44 
 
 
75 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1666  phosphopantetheine-binding  43.28 
 
 
71 aa  53.9  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5695  hypothetical protein  41.18 
 
 
76 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.114455 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1327  hypothetical protein  37.88 
 
 
77 aa  47.4  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3111  hypothetical protein  32.39 
 
 
77 aa  45.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00991  acyl carrier protein  42.11 
 
 
74 aa  43.9  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06175  acyl carrier protein  42.11 
 
 
74 aa  43.9  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.241601  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00674  hypothetical protein  38.98 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4287  hypothetical protein  34.55 
 
 
74 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>