13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0082 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0082  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  310  4.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0448556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4407  hypothetical protein  60.43 
 
 		 150 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.521352  normal  0.0718674 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0560  hypothetical protein  56.08 
 
 		 160 aa  169  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0846  hypothetical protein  57.46 
 
 		 152 aa  159  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0290395  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3688  hypothetical protein  56.72 
 
 		 152 aa  155  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.665101  normal  0.0139378 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3499  hypothetical protein  56.72 
 
 		 152 aa  155  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0751  hypothetical protein  56.72 
 
 		 152 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.23586  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3567  hypothetical protein  56.72 
 
 		 152 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0331307  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3976  hypothetical protein  50 
 
 		 151 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3059  hypothetical protein  52.7 
 
 		 152 aa  153  7e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0022  hypothetical protein  31.71 
 
 		 175 aa  47  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4089  hypothetical protein  27.27 
 
 		 181 aa  44.7  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0206  hypothetical protein  29.41 
 
 		 203 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.738577  normal  0.726212 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>