18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0022 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0022  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  360  7.0000000000000005e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0206  hypothetical protein  45.56 
 
 
203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.738577  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3305  hypothetical protein  29.48 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.854126  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1118  hypothetical protein  34.34 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.663601  normal  0.45648 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4089  hypothetical protein  30.11 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1655  hypothetical protein  38.2 
 
 
165 aa  62.8  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6357  hypothetical protein  34.09 
 
 
223 aa  61.6  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0560  hypothetical protein  30.54 
 
 
160 aa  58.2  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3976  hypothetical protein  33 
 
 
151 aa  55.5  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3059  hypothetical protein  32.58 
 
 
152 aa  54.3  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4407  hypothetical protein  33.67 
 
 
150 aa  53.9  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.521352  normal  0.0718674 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0846  hypothetical protein  32.67 
 
 
152 aa  52.4  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0290395  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3567  hypothetical protein  29.7 
 
 
152 aa  48.1  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0331307  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3688  hypothetical protein  29.7 
 
 
152 aa  48.1  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.665101  normal  0.0139378 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0751  hypothetical protein  29.7 
 
 
152 aa  48.1  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.23586  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3499  hypothetical protein  29.7 
 
 
152 aa  48.1  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0082  hypothetical protein  31.71 
 
 
149 aa  47  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0448556  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01269  hypothetical protein  27.66 
 
 
191 aa  47  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>