22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3773 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3716  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  311  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3899  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  311  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0004514  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0552  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  311  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000251234  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3773  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  311  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00171921  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3286  hypothetical protein  97.35 
 
 
151 aa  303  6e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0978645  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0592  hypothetical protein  92.05 
 
 
151 aa  287  4e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.396305  hitchhiker  0.00000978243 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0591  hypothetical protein  92.05 
 
 
151 aa  287  4e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000724543 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3438  hypothetical protein  92.05 
 
 
151 aa  286  6e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463398  normal  0.538474 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0595  hypothetical protein  92.05 
 
 
183 aa  286  7e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3031  hypothetical protein  72.85 
 
 
151 aa  237  5e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.204122  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3316  hypothetical protein  67.55 
 
 
151 aa  218  3e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00133884  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0791  hypothetical protein  66.89 
 
 
151 aa  217  3.9999999999999997e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254088 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3546  hypothetical protein  65.56 
 
 
151 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4177  hypothetical protein  63.58 
 
 
170 aa  209  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0560  hypothetical protein  60.93 
 
 
151 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.312654  normal  0.199565 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3210  hypothetical protein  52.98 
 
 
151 aa  157  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000480541  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0007  hypothetical protein  29.25 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.250623  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2877  hypothetical protein  37.5 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2338  hypothetical protein  21.25 
 
 
152 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0351518  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2125  hypothetical protein  21.25 
 
 
152 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000810888  normal  0.58811 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2137  hypothetical protein  23.26 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.788442  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1939  ATPase  22.08 
 
 
152 aa  48.9  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>