20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2877 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2877  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  307  2.9999999999999997e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1939  ATPase  31.82 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3716  hypothetical protein  37.5 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3899  hypothetical protein  37.5 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0004514  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3773  hypothetical protein  37.5 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00171921  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0552  hypothetical protein  37.5 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000251234  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3286  hypothetical protein  37.5 
 
 
151 aa  55.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0978645  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2338  hypothetical protein  24.84 
 
 
152 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0351518  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2125  hypothetical protein  24.84 
 
 
152 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000810888  normal  0.58811 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0591  hypothetical protein  36.11 
 
 
151 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000724543 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2137  hypothetical protein  25.35 
 
 
143 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.788442  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0592  hypothetical protein  36.11 
 
 
151 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.396305  hitchhiker  0.00000978243 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4177  hypothetical protein  35.14 
 
 
170 aa  51.6  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0595  hypothetical protein  36.11 
 
 
183 aa  51.6  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0560  hypothetical protein  32.97 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.312654  normal  0.199565 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3438  hypothetical protein  34.72 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463398  normal  0.538474 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0791  hypothetical protein  32.43 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254088 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3031  hypothetical protein  30.56 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.204122  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3546  hypothetical protein  32.43 
 
 
151 aa  44.3  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3316  hypothetical protein  28.38 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00133884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>