20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0612 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_0612  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  201  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3052  hypothetical protein  29.35 
 
 
110 aa  44.7  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2283  hypothetical protein  37.5 
 
 
105 aa  44.3  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2984  putative transposase orf1 for insertion sequence element  37.25 
 
 
110 aa  43.9  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00919118  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2649  hypothetical protein  28.92 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00364  hypothetical protein  33.33 
 
 
94 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01285  hypothetical protein  33.33 
 
 
94 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.079941  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01414  hypothetical protein  33.33 
 
 
94 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0268  hypothetical protein  30.34 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.38737  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2939  ISAfe4, tranposase orf1  30.34 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0110875  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1754  hypothetical protein  30.34 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.695573 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2091  hypothetical protein  30.34 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2468  ISAfe4, tranposase orf1  30.34 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.191238  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2622  hypothetical protein  31.67 
 
 
116 aa  40.8  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0262298  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2652  hypothetical protein  31.67 
 
 
116 aa  40.8  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117038  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0283  hypothetical protein  27.78 
 
 
102 aa  40.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.573299  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1709  ISAfe4, tranposase orf1  30.34 
 
 
110 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0275  hypothetical protein  27.78 
 
 
102 aa  40.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1328  conserved hypothetical protein, possibly transposase  30.34 
 
 
110 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0265671 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4314  hypothetical protein  40.54 
 
 
109 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>