19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0268 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2939  ISAfe4, tranposase orf1  100 
 
 		 110 aa  226  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0110875  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2468  ISAfe4, tranposase orf1  100 
 
 		 110 aa  226  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.191238  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2091  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  226  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1754  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  226  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.695573 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0268  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  226  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.38737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1709  ISAfe4, tranposase orf1  98.18 
 
 		 110 aa  222  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1328  conserved hypothetical protein, possibly transposase  98.18 
 
 		 110 aa  222  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0265671 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2984  putative transposase orf1 for insertion sequence element  25.44 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00919118  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2652  hypothetical protein  37.21 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2622  hypothetical protein  37.21 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0262298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1276  hypothetical protein  31.58 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117494  normal  0.0907149 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5013  transposase IS3/IS911 family protein  33.66 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2339  hypothetical protein  33.82 
 
 		 107 aa  41.2  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0612  hypothetical protein  30.34 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2649  hypothetical protein  37.21 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1834  hypothetical protein  29.9 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00046104  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2625  hypothetical protein  29.9 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2705  hypothetical protein  29.9 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.49136  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2968  hypothetical protein  29.9 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.061041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>