14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_12610 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_12610  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  483  1e-135  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7389  hypothetical protein  32.68 
 
 
219 aa  82.4  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0996  CRISPR-associated protein, Csm2 family  30.05 
 
 
220 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.462721  normal  0.765042 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2209  hypothetical protein  31.43 
 
 
225 aa  81.6  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2063  hypothetical protein  29.95 
 
 
214 aa  79  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.336699  normal  0.216808 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2869  hypothetical protein  26.11 
 
 
223 aa  70.1  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3540  hypothetical protein  27.8 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1042  hypothetical protein  29.9 
 
 
208 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1293  hypothetical protein  26.24 
 
 
194 aa  55.5  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.464309  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1558  hypothetical protein  31.16 
 
 
224 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.420062  normal  0.625106 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2149  abortive phage resistance protein  26.56 
 
 
196 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.744102 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0790  hypothetical protein  30.07 
 
 
162 aa  43.5  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4360  hypothetical protein  40 
 
 
190 aa  42.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0299  hypothetical protein  25.23 
 
 
221 aa  42.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153747  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>