20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1558 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1558  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  460  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.420062  normal  0.625106 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0790  hypothetical protein  69.57 
 
 
162 aa  231  6e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0299  hypothetical protein  50.44 
 
 
221 aa  207  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153747  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2209  hypothetical protein  41.15 
 
 
225 aa  155  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0996  CRISPR-associated protein, Csm2 family  34.31 
 
 
220 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.462721  normal  0.765042 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2063  hypothetical protein  33.33 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.336699  normal  0.216808 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1567  hypothetical protein  44 
 
 
144 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7389  hypothetical protein  30.11 
 
 
219 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1293  hypothetical protein  33.33 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.464309  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3540  hypothetical protein  27.35 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2149  abortive phage resistance protein  27.75 
 
 
196 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.744102 
 
 
-
 
NC_002950  PG0078  hypothetical protein  28.38 
 
 
232 aa  64.7  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1042  hypothetical protein  26.98 
 
 
208 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3792  abortive phage resistance protein-like  30.6 
 
 
198 aa  60.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1919  abortive phage resistance protein-like  30.27 
 
 
198 aa  58.9  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000352931  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11633  hypothetical protein  25 
 
 
257 aa  49.7  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.389497  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4360  hypothetical protein  30.68 
 
 
190 aa  49.3  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12610  hypothetical protein  31.16 
 
 
233 aa  48.5  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2869  hypothetical protein  28.37 
 
 
223 aa  48.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0048  hypothetical protein  27.91 
 
 
111 aa  41.6  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>