14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2022 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2022  thaumatin, pathogenesis-related protein  100 
 
 
583 aa  1207    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.431794  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5896  putative lipoprotein transmembrane  37.19 
 
 
270 aa  116  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  30.7 
 
 
3073 aa  107  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4505  hypothetical protein  34.85 
 
 
259 aa  95.9  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  0.594924 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1932  hypothetical protein  36.52 
 
 
253 aa  94.7  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608021 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1241  hypothetical protein  34.83 
 
 
260 aa  93.2  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0801  putative lipoprotein transmembrane  34.25 
 
 
245 aa  91.3  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0880  hypothetical protein  34.83 
 
 
267 aa  91.3  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00390614  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1362  hypothetical protein  34.83 
 
 
267 aa  91.3  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3998  hypothetical protein  31.87 
 
 
236 aa  91.3  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00166505  normal  0.822045 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1340  hypothetical protein  34.27 
 
 
325 aa  90.9  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.470908  normal  0.0500322 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4899  Thaumatin pathogenesis-related protein  31.55 
 
 
442 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00630  conserved hypothetical protein  26.9 
 
 
536 aa  50.1  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1283  hypothetical protein  26.32 
 
 
800 aa  47  0.0009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>