48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0341 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0341  TnpA  100 
 
 
43 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.684439  normal  0.292636 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0334  TnpA  93.02 
 
 
43 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0333  hypothetical protein  88.37 
 
 
43 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.817297  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0341  hypothetical protein  86.05 
 
 
43 aa  79.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0997295 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2222  transposase, Mutator family  62.16 
 
 
289 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00694083  hitchhiker  0.0000000000000060867 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1564  transposase  62.16 
 
 
42 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000376737 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0005  IS1414, transposase  59.46 
 
 
402 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0682409  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3068  transposase mutator type  51.35 
 
 
402 aa  40  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1806  transposase mutator type  51.35 
 
 
402 aa  40  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337522  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4201  transposase mutator type  51.35 
 
 
402 aa  40  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.102983  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2551  IS285 transposase  51.35 
 
 
402 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.554053  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2370  IS285 transposase  51.35 
 
 
402 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.284063 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2585  IS285 transposase  51.35 
 
 
402 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000265507  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2640  IS285 transposase  51.35 
 
 
402 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.989951  normal  0.230148 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2690  IS285 transposase  51.35 
 
 
402 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.1618  normal  0.0882844 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2692  IS285 transposase  51.35 
 
 
402 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0200567  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2822  IS285 transposase  51.35 
 
 
402 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0900869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2868  IS285 transposase  51.35 
 
 
402 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2902  IS285 transposase  51.35 
 
 
402 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000738457  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3007  IS285 transposase  51.35 
 
 
402 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000643247  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3088  IS285 transposase  51.35 
 
 
402 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3508  IS285 transposase  51.35 
 
 
402 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0195612  normal  0.0648986 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4091  IS285 transposase  51.35 
 
 
402 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4124  IS285 transposase  51.35 
 
 
402 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410453  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0427  transposase mutator type  51.35 
 
 
402 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00329499  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0899  IS285 transposase  51.35 
 
 
402 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0200567  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0291  IS285, transposase  51.35 
 
 
402 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0178576  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0113  IS256 family transposase  51.35 
 
 
402 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  7.859819999999999e-35  hitchhiker  3.4908100000000004e-107 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0017  IS285 transposase  51.35 
 
 
402 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0178633  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0144  IS285 transposase  51.35 
 
 
402 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278135  hitchhiker  0.0000241688 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0184  IS285 transposase  51.35 
 
 
402 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000394328  hitchhiker  0.000122824 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0209  IS285 transposase  51.35 
 
 
402 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.976414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0400  IS285 transposase  51.35 
 
 
402 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.104694 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0404  IS285 transposase  51.35 
 
 
402 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078485 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0563  IS285 transposase  51.35 
 
 
402 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0610  IS285 transposase  51.35 
 
 
402 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0069093  normal  0.361449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0878  IS285 transposase  51.35 
 
 
402 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.601324  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0015  IS285, transposase  51.35 
 
 
402 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000501092  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1244  IS285 transposase  51.35 
 
 
402 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250762  hitchhiker  0.0000000000571449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1704  IS285 transposase  51.35 
 
 
402 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0510914  hitchhiker  0.000569964 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1891  IS285 transposase  51.35 
 
 
402 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.940968  hitchhiker  0.000645661 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1925  IS285 transposase  51.35 
 
 
402 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.124366  normal  0.380546 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1936  IS285 transposase  51.35 
 
 
402 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.912598  normal  0.504152 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2146  IS285 transposase  51.35 
 
 
402 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0965299  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2169  IS285 transposase  51.35 
 
 
402 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0142554 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2188  IS285 transposase  51.35 
 
 
402 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.49748 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2328  IS285 transposase  51.35 
 
 
402 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0755498  normal  0.441869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2337  IS285 transposase  51.35 
 
 
402 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000509727  normal  0.0644428 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>