30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2672 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2778  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  268  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0378849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2557  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  268  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000359552  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2648  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  268  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000364117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2672  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  268  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.617883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2606  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  268  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0272315  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1260  protein of unknown function DUF1323  70.54 
 
 		 130 aa  188  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000040747  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2536  hypothetical protein  70.54 
 
 		 130 aa  188  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000244996  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2688  hypothetical protein  70.54 
 
 		 130 aa  188  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000866159  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1273  hypothetical protein  70.54 
 
 		 130 aa  188  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000818109  hitchhiker  0.00416875 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2780  hypothetical protein  70.54 
 
 		 130 aa  188  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000295797  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3629  hypothetical protein  69.77 
 
 		 130 aa  187  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00521171  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02305  predicted DNA-binding transcriptional regulator  69.77 
 
 		 130 aa  187  5e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000385128  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02266  hypothetical protein  69.77 
 
 		 130 aa  187  5e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000365685  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2549  hypothetical protein  68.99 
 
 		 130 aa  185  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0542951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2930  hypothetical protein  64.46 
 
 		 124 aa  161  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000196021  normal  0.0943675 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2929  putative negative regulator  39.02 
 
 		 115 aa  91.7  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  0.0982553 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2605  hypothetical protein  36.51 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0210143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2671  hypothetical protein  36.51 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2647  hypothetical protein  36.51 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00270532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2556  hypothetical protein  36.51 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000209332  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2777  hypothetical protein  36.51 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0729931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1274  hypothetical protein  37.01 
 
 		 119 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000646681  hitchhiker  0.00411396 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2548  hypothetical protein  36.07 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0284768  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02304  predicted DNA-binding transcriptional regulator  37.9 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000411475  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02265  hypothetical protein  37.9 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000342341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1261  protein of unknown function DUF1323  37.9 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000484651  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3628  hypothetical protein  37.9 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00496583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2535  hypothetical protein  37.9 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2687  hypothetical protein  37.9 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000217173  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2781  hypothetical protein  37.1 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000051142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>