34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0286 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0286  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  137  6e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3957  protein of unknown function DUF1107  83.82 
 
 		 70 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4034  hypothetical protein  83.82 
 
 		 70 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4059  hypothetical protein  83.82 
 
 		 70 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.760979  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4152  hypothetical protein  83.82 
 
 		 70 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0334  hypothetical protein  81.54 
 
 		 70 aa  115  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3655  hypothetical protein  81.54 
 
 		 70 aa  115  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3641  hypothetical protein  81.54 
 
 		 70 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.259283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0303  hypothetical protein  81.54 
 
 		 70 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3837  hypothetical protein  81.54 
 
 		 70 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0312  hypothetical protein  80.95 
 
 		 70 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3320  hypothetical protein  80.95 
 
 		 82 aa  111  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0244374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0401  hypothetical protein  73.13 
 
 		 70 aa  110  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0411  hypothetical protein  80.95 
 
 		 67 aa  108  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.558504  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0266  hypothetical protein  70.77 
 
 		 70 aa  105  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.457454  hitchhiker  0.00369289 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4192  hypothetical protein  70.15 
 
 		 70 aa  104  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00124153  normal  0.405452 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002486  hypothetical protein  30.91 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0278868  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03548  hypothetical protein  30.91 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2050  hypothetical protein  29.31 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21203  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0395  hypothetical protein  32.73 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0710547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4804  hypothetical protein  32.73 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4685  hypothetical protein  32.73 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00987973  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4770  hypothetical protein  32.73 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4825  hypothetical protein  32.73 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.486478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4674  hypothetical protein  32.73 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.013145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04051  hypothetical protein  32.73 
 
 		 68 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5734  hypothetical protein  32.73 
 
 		 68 aa  40  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4786  hypothetical protein  32.73 
 
 		 68 aa  40  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4865  hypothetical protein  32.73 
 
 		 68 aa  40  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4695  hypothetical protein  32.73 
 
 		 68 aa  40  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3790  hypothetical protein  32.73 
 
 		 68 aa  40  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04088  hypothetical protein  32.73 
 
 		 68 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4470  hypothetical protein  32.73 
 
 		 68 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3775  protein of unknown function DUF1107  32.73 
 
 		 68 aa  40  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>