43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3320 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3320  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  164  5e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0244374  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0334  hypothetical protein  90 
 
 		 70 aa  130  6e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3655  hypothetical protein  90 
 
 		 70 aa  130  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3641  hypothetical protein  87.14 
 
 		 70 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.259283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0303  hypothetical protein  87.14 
 
 		 70 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3837  hypothetical protein  87.14 
 
 		 70 aa  128  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0312  hypothetical protein  85.71 
 
 		 70 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0401  hypothetical protein  81.43 
 
 		 70 aa  123  9e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3957  protein of unknown function DUF1107  85.51 
 
 		 70 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4034  hypothetical protein  85.51 
 
 		 70 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4152  hypothetical protein  85.51 
 
 		 70 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4059  hypothetical protein  85.51 
 
 		 70 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.760979  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0266  hypothetical protein  80 
 
 		 70 aa  121  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.457454  hitchhiker  0.00369289 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4192  hypothetical protein  81.43 
 
 		 70 aa  118  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00124153  normal  0.405452 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0286  hypothetical protein  80.95 
 
 		 67 aa  111  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0411  hypothetical protein  72.73 
 
 		 67 aa  102  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.558504  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002486  hypothetical protein  35 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0278868  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03548  hypothetical protein  35 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2050  hypothetical protein  34.38 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21203  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0395  hypothetical protein  33.33 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0710547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0785  protein of unknown function DUF1107  35.59 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179508  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4804  hypothetical protein  33.33 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4685  hypothetical protein  33.33 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00987973  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4674  hypothetical protein  33.33 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.013145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4770  hypothetical protein  33.33 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4825  hypothetical protein  33.33 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.486478  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04088  hypothetical protein  37.21 
 
 		 68 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4470  hypothetical protein  37.21 
 
 		 68 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04051  hypothetical protein  37.21 
 
 		 68 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3775  protein of unknown function DUF1107  37.21 
 
 		 68 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5734  hypothetical protein  37.21 
 
 		 68 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4865  hypothetical protein  37.21 
 
 		 68 aa  44.3  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4695  hypothetical protein  37.21 
 
 		 68 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3790  hypothetical protein  37.21 
 
 		 68 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4786  hypothetical protein  37.21 
 
 		 68 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2536  hypothetical protein  33.33 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3419  hypothetical protein  35.59 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.483164  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3578  protein of unknown function DUF1107  35.59 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.438449  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0456  hypothetical protein  37.21 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0230817  normal  0.0951842 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0819  protein of unknown function DUF1107  33.9 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.500375  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3773  hypothetical protein  32.56 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3959  hypothetical protein  32.56 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.289432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3628  hypothetical protein  32.56 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>