22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1003 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1003  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  346  7e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.787679  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1434  hypothetical protein  89.82 
 
 		 349 aa  310  7.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000482166  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2800  hypothetical protein  87.43 
 
 		 349 aa  304  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.78052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1440  hypothetical protein  86.83 
 
 		 351 aa  301  2.0000000000000002e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1763  hypothetical protein  86.83 
 
 		 348 aa  299  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000197181  hitchhiker  0.00806436 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1174  hypothetical protein  85.63 
 
 		 351 aa  298  3e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000255184  hitchhiker  0.000000000000402769 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1266  hypothetical protein  85.03 
 
 		 351 aa  291  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00314635  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1767  hypothetical protein  83.83 
 
 		 349 aa  288  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000332816  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2076  hypothetical protein  83.83 
 
 		 349 aa  289  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2083  protein of unknown function DUF1277  83.83 
 
 		 349 aa  289  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000880511  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1158  hypothetical protein  87.66 
 
 		 349 aa  287  4e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.53743 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2199  hypothetical protein  81.44 
 
 		 349 aa  283  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000639622  hitchhiker  0.000000000128788 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1522  hypothetical protein  79.64 
 
 		 349 aa  281  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2268  hypothetical protein  79.64 
 
 		 349 aa  280  6.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.582934  hitchhiker  0.000000000247351 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3155  hypothetical protein  79.64 
 
 		 349 aa  280  7.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000300414  hitchhiker  0.0000000000395416 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1844  hypothetical protein  79.64 
 
 		 349 aa  280  7.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000141733  hitchhiker  0.0000000024539 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4451  hypothetical protein  48.32 
 
 		 329 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000182249  unclonable  0.00000000157695 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2153  hypothetical protein  47.65 
 
 		 329 aa  153  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000696662  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2477  hypothetical protein  44.97 
 
 		 331 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal  0.0132225 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2253  hypothetical protein  46.63 
 
 		 339 aa  144  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.215699  hitchhiker  0.00569814 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2279  hypothetical protein  44.3 
 
 		 331 aa  144  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00859838  hitchhiker  4.1808499999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2614  hypothetical protein  42.47 
 
 		 329 aa  130  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.4112  decreased coverage  0.00553167 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>